银行保函与信用证都是银行开立的，同属于银行信用，而且都被用于国际贸易中的货款支付，但两者有很大的区别，主要表现在：
1、银行付款责任不同
在信用证业务中，开证行承担性付款责任;在银行保函业务中，见索即付保函银行承担性付款责任，而有条件保函银行则承担第二性付款责任。
2、适用范围不同
信用证业务一般只适用于货物买卖，而银行保函除适用货物买卖外，更多的用于国际工程承包、投标招标、借款贷款等业务，因而适用范围更广。
3、对单据要求不同
信用证项下货运单据是付款的依据，单证不符银行可拒付，银行保函项下单据不是付款的依据，一般凭索赔书或其他文件付款。
4、能否融资不同
信用证项下受益人可通过议付取得资金融通，而银行保函项下单据不成为索汇的依据，也不能作抵押贷款，受益人不能取得资金融通。
5、与合同关系不同
信用证与合同是两个完全独立的契约;而出具有条件的保函的银行，当受益人以对方不履约，提交书面陈述或证明，要求银行履行赔偿诺言时，银行一般须证实不履约的情况，如果双方意见不一，保证银行就会被牵连到交易双方的合同纠纷中去。有的国家，如美国、日本等，法律禁止银行介入商事纠纷，故不允许银行开立银行保函。
银行保函又称"银行保证书"、"银行信用保证书"，简称"保证书"，银行作为保证人向受益人开立的保证文件。银行保函包括履约保函、不上网保函、上网保函、预付款保函、投标保函、维修保函、预留金保函、税款保付反担保函、海关风险保证金保函等。
国际担保业务中银行使用的绝大多数为见索即付保函，见索即付保函一经开立，银行将成为付款人，承担很大的风险。因此，为降低风险，银行在开立见索即付保函时应注意以下问题：
1、保函应将赔付条件具体化，应有具体担保金额、受益人、委托人、保函有效期限等。
2、银行应要求委托人提供相应的反担保或提供一定数量的保证金，银行在保证金的额度内出具保函。
3、银行向境外受益人出具保函，属对外担保，还必须注意诸如报经外汇管理局批准等对外担保的法律规定。
4、银行开立保函，还应该对基础合同的真实性进行认真审核，以防诈骗。
履约保函的核心作用在于增强合同履行的可信度与性，保护受益人的合法权益。其作用包括：
a.信用增强：通过金融机构的信用背书，提升申请人履行合同的信用等级。
b.风险转移：将申请人违约的风险部分转移给金融机构，减轻受益人的直接损失。
c.促进合作：在交易双方之间建立更加稳固的信任基础，促进交易的顺利进行。