氨基酸的种类和含量
燕窝中的氨基酸种类丰富，富含苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、酪氨酸和精氨酸等。燕窝中的水解氨基酸含量达42.272%，且必需氨基酸含量占氨基酸总量的42%；同时，呈鲜味特征的氨基酸（天门冬氨酸和谷氨酸）和呈芳香味特征的氨基酸（酪氨酸和苯丙氨酸）含量较高，表明燕窝的味道鲜美。食物营养价值的优劣主要取决于所含氨基酸的种类、数量和比例。联合国粮农组织和世界卫生组织提出了食品中必需氨基酸参考模式谱，规定了人体必需氨基酸占总氨基酸的质量比以及必需氨基酸与非必需氨基酸的质量比分别为40%和60%。
燕窝的营养价值非常有限，性价比极低。如果平时食用适量的肉蛋奶，加适度海产品，就足以获取燕窝能提供的一切营养价值。美国普度大学农业与生物系食品工程专业博士云无心、中国第四军医大学营养与食品卫生教研室主任王枫均对记者表示，以蛋白质为例，燕窝就不如鸡蛋、牛奶“优质”。而从满足人体需求的角度来说，燕窝的氨基酸组成并不好，它所能提供的营养为不完全蛋白质，对人体的好处尚不如鸡蛋和牛奶。中国食品营养委员会主任姬黎霞也告诉《科技生活》周刊，现代的医药研究证实，燕窝含有蛋白质、微量元素及氨基酸。但是对于含有以上物质的食物，并不只是燕窝独有，一些平民化的食物中也能获得，“比如银耳、百合、山药等含有粘液的食物。”
海参的内骨骼多不发达，必须用显微镜才能看见的许多微小石灰质骨片埋没于外皮之下，数目一般都很多。观察骨片应作些处理，简单的方法是取一小片皮肤，置于玻片上，然后滴1-2滴次氯酸钠溶液于皮肤上，1-2分钟，次氯酸钠溶液会把皮肤组织腐蚀掉，而剩下骨片，再加1-2滴蒸馏水，盖上盖玻片，置于显微镜之下便能观察清楚。海参骨片形状美丽而多变，是海参分类重要的依据，常见的骨片有桌形体、扣状体、杆状体、穿孔板、花纹样体、轮形体和锚形体等。海参骨片数量很多，有人计算过1个丑海参（Holothuria impatiens）有约2000万个骨片。
海参咽部围绕一环钙质骨板，称为石灰环，由10块骨板组成，5个辐位的骨板，称辐片，5个间辐位的骨板，称间辐片。石灰环是海参特有的器官，它可能和海胆的亚里士多德提灯（Aristotle's lantern）同源。石灰环形态在海参分类上也很重要。
消化道发达，开始于口，经过食道到肠管，肠管在体腔中作3次弯曲，先下降，再上升，再下降，后端膨大，形成泄殖腔，后开口于肛门。肠管靠肠系膜附着于体壁上，泄殖腔富有肌肉，能膨胀和收缩。