虫草毒性低，小鼠腹腔注射虫草浸提液5g/kg，没有死亡、10-20g/kg则部分死亡。中毒症状是先抑制后兴奋，随即因痉挛和呼吸抑制而死亡。小鼠腹腔注射虫草水提取液LD50为27.8g/kg，皮下注射则为38.0g/kg。小鼠腹腔注射虫草菌水提取液LD50为17.9g/kg，皮下注射则为17.1g/kg。亦有人认为虫草菌水煎剂毒性比虫草为小。虫草菌醇提物给小鼠静注LD50为24.5g/kg，腹腔注射为35.2g/kg。凉山虫草的毒性低于冬虫夏草，小鼠腹腔注射浸剂LD50为24.26g/kg，后者为19.46g/kg。长期毒性试验未见明显异常。小酿灌服虫草或虫草菌耐受量均在45g/kg以上。小鼠皮下注射虫草多糖100mg/kg，连续14d，末见明显毒性。家兔灌服虫草菌水提取液10g/kg，连续3个月，对外周血象，肝、肾功能及各重要脏器均无明显毒性反应，对淋巴细胞微核率、染色体畸变率、姐妹染色单体互换率均无明显影响，提示对机体无明显致突变作用。虫草菌粉1.25-5g/kg给孕大鼠灌服，对其受孕、着床、吸收、活胎数写对照组无差别，胎鼠全部成活，胎鼠体重、体长和尾长与对照组亦无明显差异。
1、肾阳不足，精血亏虚之阳痿遗精、腰膝酸痛可单用浸酒服，或与淫羊藿、杜仲、巴戟天等补阳药配成复方用。
2、劳嗽痰血多用。可单用，或与沙参、川贝母、阿胶、生地、麦冬等同用。若肺肾两虚，摄纳无权，气虚作喘者，可与人参、黄芪、胡桃肉等同用。
3、病后体虚不复或自汗畏寒，可以本品与鸡、鸭、猪肉等炖服，有固本，补肺益卫之功。
冬虫夏草配补骨脂：冬虫夏草长于温肾补肺，止嗽定喘；补骨脂善于，纳气平喘。两药配伍，可增强，纳气定喘的作用。适用于肺肾两虚，摄纳无权，久咳虚喘等。
冬虫夏草配杜仲：冬虫夏草长于温肾补肺；杜仲善于补益肝肾。两药配伍，可增强的作用。适用于肾阳不足的阳痿遗精，遗尿等。
冬虫夏草配枸杞子：冬虫夏草长于温肾补肺；枸杞子善于补益肝肾。两药配伍，可增强温肾补肝的作用。适用于肝肾亏虚之腰痛乏力等。
冬虫夏草配阿胶：冬虫夏草长于温肾补肺；阿胶善于养血止血。两药配伍，可增强温肾助阳，养血止血的作用。适用于气阴不足，劳嗽咳血等。