北中医三院目前编制床位520张，有34个临床科室，5个医技科室，4个门诊部，3个社区卫生服务站;医院有正高职称专家62名，副高职称专家113名，具有博士学位人员161名，硕士学位人员204名。医院有北京中医药大学经方现代临床应用研究所、北京中医药大学骨伤科研究所。
北京中医三院位于北京亚奥核心区域，毗邻奥林匹克公园、鸟巢，元大都城垣遗址公园。医院始建于1964年10月,历经中国人民解放军基建工程兵北京指挥部医院、北京城建医院、北京冶金医院，2006年9月划转到北京中医药大学，成立北京中医药大学第三附属医院。
预约挂号，挂专家号更是“一号难求”,这是当前许多大型医院的普遍现象。预约挂号是各地近年来开展的一项便民就医服务，旨在缩短看病流程，节约患者时间。这种预约挂号大多通过医疗机构提供的电话或者网络进行，基本上是免费或者只收取很少的手续费。由于预约挂号需要事先登记患者的信息，并且可以减少在医院挂号窗口排队等待之苦，因此它一定程度上也有利于改善就医环境，促进“实名制”的推行，受到了不少患者的肯定和欢迎。 2016年初开始，北京市在其市属医院推行预约挂号制度，该制度正在进行普及。
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