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船员体检分两种。办理或更换证书时要求体检表，证明本人适合上船工作，必须在海事局指定的医院进行体检。上船前办理健康证，这个是所有出国人员都必须持有的，在检验检疫局的检验检疫中心进行。
一、一般检查：身高、体重、脉搏、血压、血型、体温。
二、内外科检查：皮肤、巩膜、淋巴结，头部、颈部，心脏，腹部，脊柱、四肢，神经精神系统，泌尿生殖系统。
三、五官科：裸眼视力，辨色力，听力，眼、耳、鼻、喉。
四、心电图。
五、腹部超声（肝胆脾肾)。
六、胸部X线。
七、实验室检查：
A、艾滋病病毒抗体。
B、梅毒血清学检测。
C、乙肝表面抗原。
D、丙肝抗体。
E、丙氨酸氨基转氨酶。
F、血常规。
G、尿常规。
八、其他(如在船做厨工需检查)：大便培养(沙门氏菌和志贺氏菌)。
入职体检是专项体检之一，旨在通过体检保证入职员工的身体状况适合从事该专业工作，在集体生活中不会造成传染病流行，不会因其个人身体原因影响他人。
入职体检有相对固定的体检项目与体检标准，选择专业体检中心能保证体检质量。但由于入职体检内容较为简单，所以不能完全代替健康体检。