履约保证金必须游离在工程造价之外，只作为中标方违约时招标方损失的补偿，招标人必须是具备招标能力的法人，其建设资金已经到位，不能把履约保证金作为工程造价的补充。因此，履约保证金具有独立性，必须由双方认可的机构负责收缴、储存、执行和返还。
根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》规定，招标文件要求中标人提交履约保证金的，中标人应当按照招标文件的要求提交。履约保证金不得超过中标合同金额的10%。招标人超过规定的比例收取投标保证金、履约保证金或者不按照规定退还投标保证金及银行同期存款利息的，由有关行政监督部门责令改正，可以处5万元以下的罚款；给他人造成损失的，依法承担赔偿责任。
提交主体：投标保证金由所有投标人提交;履约保证金仅由中标人提交。
保证金的期限：投标保证金应在招标文件规定的投标保证金期限内提交，一般在投标同时提交;履约保证金应在签定正式施工合同前提交;投标保证金返还时间为签定施工合同或提供履约保证时的第28天;履约保证金返还时间为工程经验收合格之日或合同约定时间。
商业保函和银行保函的区别
保证方：商业保函是由商业机构提供，而银行保函是由银行提供。
保证范围：商业保函一般保证交易相关的债务，而银行保函则可以涵盖多种领域，如担保贷款、国际贸易等。
信用级别：一般而言，银行信用级别更高，因此银行保函的信用更有保障。
成本：商业保函的成本较低，而银行保函的成本更高。
程序：银行保函比商业保函更复杂，需要更多的审批程序。
请注意，上述区别仅是一般趋势，具体情况可能会有所不同，因此在选择保函时应该考虑各方面的因素。