履约保证金强调的是保证招标方的利益或投资者的利益，这种保证既可由中标的承建商承担，也可由第三方承担，但须招标方认可方为有效，由此产生第三方承担连带责任，因此具有替代性。
预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。在这种交易中，进口人在签订合同后，向出口人开立履约保证书，由银行保证进口人按合同规定按期支付价款，同时，出口人也向对方开立还款保证书。
银行保函多用于国际贸易，国内会比较少，属于国际担保业务，而商业保函多用于国内国家。商业保函相对于银行保函要简单上许多，其不需要准备太多的资料，而且办理速度快，费用也比较低。商业保函的格式条款相对于会灵活一些，而银行保函的格式就会比较严谨，不能随意更改。
商业保函的官方定义是由除银行以外的，实力雄厚的商业机构出具的保函，一般多为专业担保公司开具的公司保函,是商业机构信用担保。包括程担保公司出具的投标保函，履约保函，预付款保函，质量保函，农民工工资支付保函，都为商业保函。