付款单位出纳员在填制完银行承兑汇票后，应将汇票的有关内容与交易合同进行核对，核对无误后填制“银行承兑协议”及银行承兑汇票清单，并在“承兑申请人”处盖单位公章。银行承兑协议一般为一式三联，银行信贷部门一联，银行会计部门一联，付款单位一联，其内容主要是汇票的基本内容，汇票经银行承兑后承兑申请人应遵守的基本条款等。待银行审核完毕之后，在银行承兑协议上加盖银行公章或合同章，在银行承兑汇票上加盖汇票专用章，并至少加盖一个经办人私章。
按照“银行承兑协议”的规定，付款单位办理承兑手续应向承兑银行支付手续费，由开户银行从付款单位存款户中扣收。按照现行规定，银行承兑手续费按银行承兑汇票的票面金额的万分之五计收，每笔手续费不足10元的，按10元计收。
纸质银行承兑汇票的承兑期限长不超过6个月，电子银行承兑汇票的承兑期限长不超过1年。承兑申请人在银行承兑汇票到期未付款的，按规定计收逾期罚息。
申请人应具备的条件
（一）依法登记注册并有效的企业法人或其他经济组织，并依法从事经营活动；持有中国人民银行核发的“贷款卡”；
（二）与出票人或前手之间具有真实合法的商品交易关系并提供相关证明材料；
（三）在开户行开立结算账户；
（四）非银行承兑汇票的出票人；
（五）满足开户行要求的其他条件。
申请人需要提供的资料
（一）通过年审的营业执照、经营许可证、企业代码证、法定代表人资格证明及本人身份证、护照原件及复印件；申请人章程、验资报告、税务登记证；
（二）经中国人民银行年审合格的贷款卡原件；
（三）申请人与其前手之间的商品交易合同、增值税发票等资料的原件及复印件；
（四）开户行要求的其他资料。