投标保函作为替代保证金的理想方式，节约了大量的投标人的资金占用问题，受到投标人的欢迎；而且投标保函是国家极力推荐的一种方式，所以投标保函近几年在国内的应用非常广泛。
预付款保函风险有哪些?
预付款保函：按国际工程承包的例行做法，合同生效一个月内，业主应向承包商预付一笔款额，通常合同总额的10-15%，由于是预付，承包商必须在合同的中期或后期偿还，通常是由工程进度款中扣回。为保证承包商能如数偿还这项预付款，业主要求承包商的银行出具等额的担保函。由于付款的偿还是分批扣还，而预付款保函则是一次性开出，如果保函中未曾写明预付款保函的担保金额，将随保函归还金额而相应减少，则很可能出现预付款已大部分偿还，而保函额不减的局面，业主随时可能全额没收保函，而承包商却不拥有全额预付款(因为很可能在业主没收保函时，承包商已经偿还了部分预付款)。预付款保函的另一个风险是保函的生效时间先于承包商收到的预付款，承包商在不知情的前提下，业主已经没收预付款保函而承包商未收到预付款。还有一种可能的风险，就是预付款已经扣还完毕，而预付款保函没有及时撤销，让业主有机可乘，留下没收保函之机。
如何避免风险?
1、常见生效条款：开立之日起生效;指定日期生效;指定事件生效。
2、常见失效条款：指定失效日期;指定失效事件。
不利的失效条款：事实性条款;不延期即付款或自动延期。
3、减额条款：如：保函金额随xx合同项下履行金额递减;或随验收金额递减。
应尽量采用：随申请人提交的每批货物的提单/发票按比例递减;随申请人提交的由受益人签署的验收证书金额递减。
4、金额敞口风险：赔付利率不明确、赔付币种与担保币种之间汇率不明确、承担无上限律师费和诉讼费等。
5、索赔条款：尽量避免索赔条款过于简单，给受益人不当索赔提供了便利，也可以增加索赔声明的内容。
6、转让风险：受益人要求保函项下的权利可单独转让的。增加了受益人索赔的不确定性，通常情况下应避免。
投标保函，一般是指银行投标保函，指在投标时，由投标人向招标人提交的，一般是和投标文件一起提交，由银行信用担保，保证投标人不提前撤回投标、中标后及时签定合同及缴纳履约保证金、不擅自修改条款、及不得提高中标价格等等的银行承诺函。