保函是可以由：担保公司、银行、保险公司出具的，因此，担保公司出具保函是一点问题没有的。
担保公司有好有坏，好的就是国企、上市企业，差点的就是普通的企业，用什么担保机构，得根据招标文件、合同、业主的要求来定，但是还有重要的一点就是，其实这个可以协商，只要你觉得能搞定业主，受益人同意了，就可以用担保公司走过场。
收费不一样，一般来说保险公司保函收费要比银行保函收费低，这个取决于所在城市，有些城市保险保函比银行保函收费还高。
出函机构不一样，一个是银行，一个是保险公司。
大众认可度，从我个人接触的企业中了解到的是银行认可度相对于保险公司高一些（仅代表个人观点），这个完全取决于业主能接受什么出函机构。
通过担保公司办理保函的优点就是不用交保证金，担保公司和保险公司长期合作，从担保公司出的保险保函和企业自己去保险公司出保函费用一样，毕竟搞批发的肯定要比单个的要便宜。
如果您有办理保函业务的需求，不妨先联系咱单位业务，询个价，出个方案，您自己对比下，看看是否合适，全国各个城市均可以出当地银行保函。
企业去银行开保函，有两种方式，一种就是存全额的资金到银行冻结，第二种就是占用担保公司在银行的钱，这种的好处就解决了企业自己去银行开保函的弊端，但是随之而来的就是多交手续费了，可是总的来说，是非常划算的，因为费率很低啊，一般也就是0.5%-3%左右的点位数，比去外边贷款强多了，而且办理周期也比自己去银行办理要快很多，比如投标保函，上午提交，下午就出保函，要是企业自己去办理，没有一周很难办下来，还得跑很多趟，准备很多的资料。