由于蒸发器、冷凝器存在大量的铜管，为增加换热效率，铜管内部存在特别设计的流道。当冷凝水或者冷却水含钙离子较高时，铜管内壁极易结垢，使换热效率降低，系统能耗明显上升。当冷凝水或者冷却水氯离子或者氟离子较高时，长时间运行易导致铜管腐蚀穿孔致使系统进水导致压缩机损坏。

空调螺杆机清洗，水冷式冷凝器的冷却水由于是开式的循环回路，一般采用的自来水经冷却塔循环使用。当水中的钙盐和镁盐含量较大时，极易分解和沉积在冷却水管上而形成水垢，影响传热。结垢过厚还会使冷却水的流通截面缩小，水量减少，冷凝压力上升。因此，当使用的冷却水的水质较差时，对冷却水管每年至少清洗一次，去除管中的水垢及其他污物。

空调螺杆机组是空调系统的主机，因其关键部件-压缩机采用螺杆式故名螺杆式冷水机，机组由蒸发器出来的状态为气体的冷媒；经压缩机绝热压缩以后，变成高温高压状态。被压缩后的气体冷媒，在冷凝器中，等压冷却冷凝，经冷凝后变化成液态冷媒，再经节流阀膨胀到低压，变成气液混合物。其中低温低压下的液态冷媒，在蒸发器中吸收被冷物质的热量，重新变成气态冷媒。气态冷媒经管道重新进入压缩机，开始新的循环。这就是冷冻循环的四个过程。也是螺杆式冷水机的主要工作原理。

中央空调冷凝器极易结垢，正常在夏季供冷期应该做日常水处理，否则在高硬度水质的环境下运行，循环水系统内溶于水中的无机盐就会随着温度的升高结晶析出，在冷凝器换热面管壁上形成水垢，导致热交换效率降低。同时硬垢增加，则能耗上升，结硬质水垢1mm厚时会增加6~10.由于水的泥土、泥沙、腐殖物形成污垢，加上、藻类等微生物及其分泌物形成的生物粘泥，会附着在冷凝器换热管壁上形成泥垢，严重时造成管路堵塞；而污垢、粘泥会影响热交换效率，多耗电能，造成高压运行，严重时造成超压停机。所有这些严重地影响了冷凝器的正常运行。冷凝器清洗分为物理清洗和化学清洗，物理清洗一般用高压水射流将冷凝器铜管的泥垢清理出来；如果结垢为硬质水垢，应进行化学清洗，物理方式无法将水垢除去。