目前国内银行保函大多用担保公司在银行授信开出，能开银行履约保函的，基本上只有建行，平安，光大等。部分招标文件要求开到基本户，涉及到银行保函的转开，只能建行操作。通过担保公司办理银行保函不需要存全额保证金，只需要缴纳很低一部分费用即可。银行保函办理周期更长，费用相对更高。担保公司保函出函速度更快，费用低，办理灵活。
商业保函，是由除银行以外的，实力雄厚的商业机构出具的保函，一般多为专业担保公司开具的公司保函，是商业机构信用担保。区别就是银行保函是以银行信用为担保，承担人是银行。而商业保函是以商业机构信用为担保，承担人是商业机构。担保公司保函(商业保函）业务办理流程一、委托人向担保公司提供相关基本资料；（1）公司营业执（三证合一的）；（2）企业资质证书；（3）招标文件（提供电子版）；（4）中标通知书；（5）施工合同（封面、协议部分）；（6) 大北京地区的实名管理通知书。
商业保函的制度保障和政策支持：（1）2016年12月27日，为贯彻落实《办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》（国办发〔2016〕49号）精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部下发了《关于印发建设工程质量保证金管理办法的通知》（建质〔2016〕295 号），为工程质量保证金管理提供了制度保障； （来源 /xinwen/2017-01/03/content_5156076.htm）（2）2017年2月12日，《办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见》，引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。（来源 /zhengce/content/2017-02/24/content_5170625.htm ）
银行保函： 1. 银行保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或担保人应申请人的请求，向受益人开立的一种书面信用担保凭证，保证在申请人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定时限范围内的某种支付或经济赔偿责任； 2. 现阶段常用的银行保函为：投标保函、履约保函、支付保函、预付款保函。 履约保函： 1. 履约保函 Performance Guarantee，指应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的业主方（受益人）做出的一种履约保证承诺； 2. 如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项； 3. 履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。 商业保函： 商业保函是指除银行以外有信誉的，实力雄厚的商业机构出具的保函。