预付款保函除在国际工程承包项目中使用外，也适用于货物进出口、劳务合作和技术贸易等业务。例如，在成套设备及大型交通工具的合同中，通常采用带有预付性质的分期付款或延期付款支付部分价款。
预付款保函和预收款退款保函的区别：预付款保函时施工方开给业主的，业务见函付预付款，施工方则要按照施工合同施工，若施工方违约，开函行将会将保函金额对应金额赔付给业务。预收款退款保函顾名思义方向相反，是业务开给施工方的，目前这种用到的比较少。
预付款保函在国际承包业务中使用时，是由承包人通过银行向业主提供。保证书规定，如申请人不履行他与受益人订立的合同的义务，不将受益人预付、支付的款项退还或还款给受益人，则由银行向受益人退还该款项。
预付款的保函和履约保函一样需要付押金，但是预付款保函却不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。