工程保函实际上是用保函代替保证金的一种做法。目前正大力向全国推行。
主要有投标保函、预付款保函、履约保函、支付保函、质量保函。
投标保函：即招投标过程中要求投标人提供银行出具的保函，以担保投标材料真实、中标后不会因不正当理由不订立合同。担保金额一般为招标价的3%。预付款保函：即担保预付款会按照合同要求使用。通常施工企业提供一张预付款保函给业主（开发商、保函受益人），业主即拨付同等金额的预付款给施工企业。担保金额一般为合同价的10%-30%。
履约保函：即担保企业签订施工合同后，能按合同履约。担保金额一般为中标价或者合同价的10%-30%。
农民工工资支付保函：即担保业主或者施工企业不拖欠农民工工资。通常受益人是工程所在地社保局或者劳动局或者建设局。
质量保函：即工程竣工验收之后，担保工程质量不出问题。通常质量保函的期限是两年，担保金额为合同价的3%-10%。
投标保函办理流程
是企业自己向银行办理的，需要满足两个条件，一是企业在该银行有开户且有一定存款作为保证金，二是该银行有开通投标保函业务。由于大部分企业和银行网点并不具备这些条件，因此企业自己向银行办理投标保函的情况并不多见。
第二是通过担保公司办理，一般可以办理投标保函的担保公司会在银行有一笔大金额的保证金，其办理流程就会简便很多。正常来讲，投标企业向担保公司提交招标文件、企业营业执照、并签署银行要求的保函协议书即可。资料齐全，一般2-3个工作日即可出函。由于投标保函属于办理量较大的业务，所以担保公司在办理时也已经流程化，需要的资料等会清晰的告诉投标企业，因此流程上非常简单。
第三是通过工程保函通办理，一般12-48小时内即可出函，方便便捷，流程如下：
（1）选择“保函类型”（银行保函或电子投标保函），填写信息，上传相应的资料（2）支付订单（3）查看确认样本（4）出函
招标人为避免投标人在评标过程中改标、撤标，或中标后拒签合同而给自身造成损失，通常都要求投标人缴纳投标保证金，以制约对方行为。投标保函是现金保证金的一种良好的替代形式。
投标保函，是指在招投标中，招标人为保证投标人不得撤销投标文件、中标后不得无正当理由不与招标人订立合同等。要求投标人在递交投标文件时一并提交的由银行出具的书面担保。
概括讲，投标保函的主要目的就是为了为保证投标人权益。
投标人递交了投标保函，在投标中，就得按照规定履行招标文件里的义务：包括在标书规定的期限内，投标人投标后，不得中途撤标、不得修改原报价；投标人中标后，必须与招标人签订合同，并在规定的时间内提供银行的履约保函。
若是投标人未按照要求履行上述义务，则提供担保的银行在受益人提出索赔时，须按照保函规定履行赔偿义务。
问题三：申请投标保函的程序有哪些？
1、申请人填写《保函申请书》并提交有关资料；
2、银行对申请人的资格、申请手续和项目可行性进行审查；
3、签定协议，落实保证金或反担保；
4、银行为申请人开立投标保函。
* 投标保函办理的金额一般为投标报价的1%—5%。
* 投标保函的期限：投标保函有效期一般为六个月以内，从开出之日起生效。