在大自然中，野生黑豚鼠是强者，它们祖祖代代生活在大自然的深山丛林、大树、竹根下或灌木丛中， 以洞为居。野生黑豚鼠由于体小力好，为了躲避豹、狼、狐、鹰、鸳等猛兽猛禽的袭击，常常只能偷偷摸摸觅食，觅食一会儿，又只能躲藏起来，肚子饿了又偷偷出来觅食；长期整日反复，便养成了昼夜行动的习性。

黑豚鼠属哺乳纲啮齿类动物，它和家兔一样都有啃咬硬物的习惯，通常称为啮齿行为。黑豚鼠是双门齿型，门齿中的对牙叫“恒齿”，出生时就有，不出现换齿现象，而且不断生长。黑豚鼠必须通过啃咬硬物本能地将它磨平，使上下颌齿面吻合。黑豚鼠的这种习性常常造成笼具食具或其他设备的损坏。为了避免造成不必要的损失，可采取一些防御措施，例如常在笼中投入带叶的树枝杆，或粗硬干草等硬物任其啃咬、磨牙；修建 舍时，在笼门的边框、边缘等处，凡是能被黑豚鼠啃到的地方，都要采取必要的加固措施。当然建饲养池就可减少这些防御措施。

黑豚鼠的嗅觉灵敏，常以嗅觉辨认异性和栖息领域，母豚鼠通过嗅觉来识别异窝仔。养户人员利用黑豚鼠的这种特性，在黑豚鼠仔需要并窝或需寄养时，采用特殊的方法使其辨别不清（如在刚出生的仔身上少量涂一点香水，母豚鼠就会给异窝幼豚鼠喂奶），从而使并窝或寄养获得成功。

豚鼠的体形在啮齿类动物中偏大，体重在700～1200克（1.5～2.5磅）之间，体长在20～25厘米（8～10英寸）之间。身材短小但是强壮有力，头较大，是身体的三分之一，眼睛大而圆，耳朵短小贴着头部，毛发粗糙而且很容易脱落，没有尾巴。豚鼠脊柱由36块脊椎骨组成，其中颈椎7枚、胸椎13枚、腰椎6枚、荐椎4枚、尾椎6枚。肋骨13对，其中6对真肋、3对假肋、4对浮肋。前脚平直而强健有力，一般都会有4个趾头，每个趾头上都有尖利的爪；后脚有3个有爪的脚趾，而且都比较长。豚鼠靠脚底走路，行走时脚跟着地。