恶意的程序：大家熟悉的恶意程序就是病毒，很多人认为病毒对数据的影响仅仅是病毒的破坏性，这是不正确的，实际上病毒的感染本身就是一种破坏，一个病毒无论他借助修改你的引导区、可执行程序还是OFFICE文档，他都把你正常的数据做了改变，当然，你可能举良性伴随性病毒这种极端的例子。但毫无疑问，他同样对数据构成了破坏，至少他减少了你的硬盘的可用空间。同时，恶意的程序还包括特洛伊木马，逻辑炸弹等等。恶意的程序造成的破坏可能是难恢复的。
其他恶意的破坏，即使不借助病毒或者其他的工具，只要拥有足够的权限，任何系统都有一定的“自毁”能力。比如依靠系统正常的删除、移动、格式化等操作也可以达到破坏数据的目的。随着网络技术的发展，威胁已经不仅于本机。
操作系统或应用软件的错误：随着操作系统和应用程序的代码量的成倍增加，BUG也在不断增加。我们常用的桌面系统WIN9X就是一个BUG大王。操作系统和应用软件的错误，往往会给人的工作带来一些不可预期的影响。比如前阶段，发现FRONTPAGE98的一个BUG，触发后会把你目录下的文件全部删除，另外，象的游戏神话II，出现了如不安装在默认目录中可能会使你丢失扩展分区这样严重的问题。
全盘崩溃和分区丢失
首先重建MBR代码区，再根据情况修正分区表。修正分区表的基本思路是查找以55AA为结束的扇区，再根据扇区结构和后面是否有FAT等情况判定是否为分区表，后计算填回，主分区表，由于需要计算，过程比较烦琐，就不仔细介绍了，希望大家用前面介绍的工具，比如NDD处理。如果文件仍然无法读取，要考虑用TIRAMINT等工具进行修复。如果在FAT表彻底崩溃的情况下，恢复某个指定文件，可以用DISKEDIT或DEBUG查找已知信息。比如文件为文本，文件中包含“软件狗”，那么我我们就要把他们转换为内码C8 ED BC FE B9 B7进行查找。