每年的农历四至五月间，积雪溶化的时候，便是冬虫夏草采收的季节，此时冬虫夏草出苗未超过一寸，如果过了这个时节，则会苗枯死，其它杂草也会生长，冬虫夏草则踪影全无；掌握了虫草的生长环境和采集季节后，寻找药源掌握采挖技术是保证产量的关键。据产区有经验的老人介绍：寻找虫草一定要把腰弯下来，或者趴在地上仔细观察（早晨易找，正中午难找），只要发现一根虫草附近还有。在密处1平方米可发现虫草10～20根。采挖虫草是一项细致而又耐心的工作，使用小铁棍或小木棒等工具刨挖虫草。距离在菌苗周围一寸左右。太近或太远都容易挖断虫体。也不可用手直接拔苗采挖。
青藏加工虫草方法很简单，把挖加的虫草及时剥去外面附着的一层黑褐色囊皮，干后除净。传统的包装方法是以6～8条，用小红绳扎成一小捆（小子）。冬虫夏草的贮藏要求不高，一般来说，只要在产区，通过正常的干燥方法处理后，放在通风的环境下，是不会变质发霉的，如果太潮湿，可以考虑用密封袋包装后保存在冰箱内便可以了。